Установка приложений из Webmin

В Webmin реализована командная строка, но вся сущность в том, что нужно уложиться в одну строчку, т.к. она не интерактивная. В итоге вы можете выполнять любые команды, которые не требуют ответа. Соответственно, чтобы поставить приложения из репозитория — вам нужно запускать уставки с ключиком -y.

Поэтому просто модифицируйте вашу команду установки добавив указанный ключик, например:

yum install sendmail -y